Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AL354861.3-201ENST00000600140 2412 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 PAK1-215ENST00000530617 3001 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 DHX30-207ENST00000457607 3748 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 ALK-205ENST00000618119 4646 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 LINC00662-206ENST00000590523 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 FERMT2-202ENST00000343279 3247 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 TGFBI-201ENST00000442011 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 RANGAP1-201ENST00000356244 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ANKZF1-203ENST00000410034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 DCAF4-213ENST00000555042 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 RPS24-204ENST00000440692 2814 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 NT5C3AP1-202ENST00000441170 1663 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 OTUD6B-201ENST00000285420 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ABL2-207ENST00000507173 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 SNHG20-202ENST00000434411 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 DBIL5P-203ENST00000536214 2677 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 C1orf216-201ENST00000270815 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms