Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms