Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SPOCK3Q9BQ16 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 KLHL38-201ENST00000325995 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AL358933.1-201ENST00000565046 2830 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms