Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.1 ms