Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms