Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms