Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms