Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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SPC24Q8NBT2 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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SPC24Q8NBT2 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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SPC24Q8NBT2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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SPC24Q8NBT2 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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SPC24Q8NBT2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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SPC24Q8NBT2 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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SPC24Q8NBT2 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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SPC24Q8NBT2 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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SPC24Q8NBT2 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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SPC24Q8NBT2 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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SPC24Q8NBT2 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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SPC24Q8NBT2 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPC24Q8NBT2 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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