Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RNF148Q8N7C7 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RNF148Q8N7C7 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RNF148Q8N7C7 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RNF148Q8N7C7 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RNF148Q8N7C7 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RNF148Q8N7C7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RNF148Q8N7C7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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