Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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CLDN19Q8N6F1 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN19Q8N6F1 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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CLDN19Q8N6F1 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN19Q8N6F1 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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CLDN19Q8N6F1 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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CLDN19Q8N6F1 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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CLDN19Q8N6F1 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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CLDN19Q8N6F1 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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CLDN19Q8N6F1 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
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CLDN19Q8N6F1 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN19Q8N6F1 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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