Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms