Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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C9orf40Q8IXQ3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf40Q8IXQ3 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf40Q8IXQ3 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf40Q8IXQ3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf40Q8IXQ3 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf40Q8IXQ3 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf40Q8IXQ3 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf40Q8IXQ3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf40Q8IXQ3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf40Q8IXQ3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf40Q8IXQ3 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf40Q8IXQ3 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf40Q8IXQ3 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf40Q8IXQ3 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf40Q8IXQ3 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf40Q8IXQ3 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf40Q8IXQ3 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf40Q8IXQ3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf40Q8IXQ3 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf40Q8IXQ3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf40Q8IXQ3 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf40Q8IXQ3 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf40Q8IXQ3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf40Q8IXQ3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf40Q8IXQ3 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf40Q8IXQ3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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C9orf40Q8IXQ3 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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C9orf40Q8IXQ3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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C9orf40Q8IXQ3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf40Q8IXQ3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf40Q8IXQ3 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C9orf40Q8IXQ3 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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C9orf40Q8IXQ3 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C9orf40Q8IXQ3 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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C9orf40Q8IXQ3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C9orf40Q8IXQ3 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C9orf40Q8IXQ3 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C9orf40Q8IXQ3 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C9orf40Q8IXQ3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C9orf40Q8IXQ3 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
C9orf40Q8IXQ3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C9orf40Q8IXQ3 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C9orf40Q8IXQ3 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf40Q8IXQ3 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf40Q8IXQ3 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf40Q8IXQ3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf40Q8IXQ3 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf40Q8IXQ3 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf40Q8IXQ3 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf40Q8IXQ3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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