Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HERC6Q8IVU3 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms