Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00299Q6ZSB3 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms