Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMIGD1Q6UXZ0 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMIGD1Q6UXZ0 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TMIGD1Q6UXZ0 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMIGD1Q6UXZ0 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMIGD1Q6UXZ0 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMIGD1Q6UXZ0 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMIGD1Q6UXZ0 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMIGD1Q6UXZ0 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMIGD1Q6UXZ0 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMIGD1Q6UXZ0 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMIGD1Q6UXZ0 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMIGD1Q6UXZ0 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TMIGD1Q6UXZ0 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMIGD1Q6UXZ0 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMIGD1Q6UXZ0 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMIGD1Q6UXZ0 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMIGD1Q6UXZ0 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMIGD1Q6UXZ0 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMIGD1Q6UXZ0 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMIGD1Q6UXZ0 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMIGD1Q6UXZ0 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMIGD1Q6UXZ0 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMIGD1Q6UXZ0 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMIGD1Q6UXZ0 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMIGD1Q6UXZ0 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMIGD1Q6UXZ0 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMIGD1Q6UXZ0 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMIGD1Q6UXZ0 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMIGD1Q6UXZ0 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMIGD1Q6UXZ0 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMIGD1Q6UXZ0 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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