Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 AC025244.1-201ENST00000505930 469 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 AC087273.1-201ENST00000519368 529 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 AC090772.3-201ENST00000583267 735 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX8Q68G74 EAF2-202ENST00000451944 960 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms