Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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