Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms