Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC57Q2TAC2 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms