Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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IMPG1Q17R60 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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IMPG1Q17R60 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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IMPG1Q17R60 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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IMPG1Q17R60 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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