Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM187BQ17R55 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms