Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFA9Q16795 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms