Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms