Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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