Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms