Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
EFNB3Q15768 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
EFNB3Q15768 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
EFNB3Q15768 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
EFNB3Q15768 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
EFNB3Q15768 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
EFNB3Q15768 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
EFNB3Q15768 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
EFNB3Q15768 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
EFNB3Q15768 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
EFNB3Q15768 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
EFNB3Q15768 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
EFNB3Q15768 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
EFNB3Q15768 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EFNB3Q15768 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EFNB3Q15768 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EFNB3Q15768 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EFNB3Q15768 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EFNB3Q15768 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EFNB3Q15768 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EFNB3Q15768 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EFNB3Q15768 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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EFNB3Q15768 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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EFNB3Q15768 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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EFNB3Q15768 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EFNB3Q15768 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EFNB3Q15768 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EFNB3Q15768 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EFNB3Q15768 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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EFNB3Q15768 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EFNB3Q15768 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
EFNB3Q15768 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
EFNB3Q15768 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
EFNB3Q15768 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
EFNB3Q15768 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EFNB3Q15768 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EFNB3Q15768 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
EFNB3Q15768 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EFNB3Q15768 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EFNB3Q15768 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
EFNB3Q15768 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EFNB3Q15768 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EFNB3Q15768 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EFNB3Q15768 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EFNB3Q15768 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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