Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEA1Q15075 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EEA1Q15075 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms