Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FRMPD4Q14CM0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FRMPD4Q14CM0 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms