Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC3Q14574 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC3Q14574 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC3Q14574 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC3Q14574 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC3Q14574 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC3Q14574 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC3Q14574 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC3Q14574 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC3Q14574 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC3Q14574 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC3Q14574 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC3Q14574 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC3Q14574 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC3Q14574 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC3Q14574 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC3Q14574 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC3Q14574 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC3Q14574 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC3Q14574 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC3Q14574 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC3Q14574 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC3Q14574 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC3Q14574 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC3Q14574 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC3Q14574 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC3Q14574 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC3Q14574 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC3Q14574 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC3Q14574 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC3Q14574 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC3Q14574 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC3Q14574 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC3Q14574 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC3Q14574 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC3Q14574 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC3Q14574 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC3Q14574 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms