Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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GBX1Q14549 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GBX1Q14549 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GBX1Q14549 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GBX1Q14549 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GBX1Q14549 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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GBX1Q14549 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GBX1Q14549 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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GBX1Q14549 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GBX1Q14549 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GBX1Q14549 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GBX1Q14549 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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GBX1Q14549 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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GBX1Q14549 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
GBX1Q14549 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GBX1Q14549 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GBX1Q14549 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GBX1Q14549 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GBX1Q14549 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GBX1Q14549 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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GBX1Q14549 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GBX1Q14549 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GBX1Q14549 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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GBX1Q14549 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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GBX1Q14549 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GBX1Q14549 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GBX1Q14549 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GBX1Q14549 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GBX1Q14549 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GBX1Q14549 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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