Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms