Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHROOM2Q13796 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
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