Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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PEX6Q13608 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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PEX6Q13608 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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PEX6Q13608 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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PEX6Q13608 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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