Protein–RNA interactions for Protein: Q13591

SEMA5A, Semaphorin-5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5AQ13591 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA5AQ13591 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms