Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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