Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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