Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms