Protein–RNA interactions for Protein: Q12894

IFRD2, Interferon-related developmental regulator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD2Q12894 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFRD2Q12894 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms