Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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FOXO1Q12778 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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FOXO1Q12778 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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FOXO1Q12778 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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FOXO1Q12778 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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FOXO1Q12778 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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FOXO1Q12778 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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FOXO1Q12778 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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