Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGNL1Q0VF96 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms