Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms