Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSRP1Q08945 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms