Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 QRICH1-204ENST00000424300 3009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 PNPLA8-208ENST00000453144 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 DUSP14-205ENST00000614411 2207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 CA10-202ENST00000442502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 SNX22-201ENST00000325881 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 AL645608.3-201ENST00000448179 3043 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 AC087164.2-201ENST00000624514 3130 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 AC092139.4-201ENST00000624318 2794 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms