Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL9Q07325 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms