Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms