Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRX4P78413 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRX4P78413 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRX4P78413 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRX4P78413 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRX4P78413 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IRX4P78413 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRX4P78413 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRX4P78413 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRX4P78413 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRX4P78413 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRX4P78413 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRX4P78413 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRX4P78413 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRX4P78413 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRX4P78413 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRX4P78413 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRX4P78413 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRX4P78413 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRX4P78413 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRX4P78413 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRX4P78413 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRX4P78413 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX4P78413 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX4P78413 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX4P78413 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX4P78413 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX4P78413 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX4P78413 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX4P78413 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX4P78413 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX4P78413 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX4P78413 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX4P78413 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX4P78413 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX4P78413 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX4P78413 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX4P78413 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX4P78413 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX4P78413 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX4P78413 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX4P78413 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX4P78413 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX4P78413 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX4P78413 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX4P78413 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX4P78413 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX4P78413 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRX4P78413 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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