Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP46P62068 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP46P62068 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP46P62068 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP46P62068 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
USP46P62068 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP46P62068 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP46P62068 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP46P62068 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP46P62068 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP46P62068 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP46P62068 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP46P62068 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP46P62068 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP46P62068 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP46P62068 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP46P62068 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP46P62068 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP46P62068 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP46P62068 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP46P62068 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP46P62068 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP46P62068 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP46P62068 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP46P62068 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP46P62068 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP46P62068 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
USP46P62068 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP46P62068 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP46P62068 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP46P62068 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP46P62068 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP46P62068 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
USP46P62068 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP46P62068 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP46P62068 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP46P62068 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP46P62068 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP46P62068 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP46P62068 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP46P62068 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP46P62068 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP46P62068 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP46P62068 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms