Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTBP60709 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTBP60709 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTBP60709 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTBP60709 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTBP60709 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTBP60709 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTBP60709 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTBP60709 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTBP60709 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTBP60709 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTBP60709 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTBP60709 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTBP60709 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTBP60709 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTBP60709 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTBP60709 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTBP60709 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTBP60709 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTBP60709 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTBP60709 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
ACTBP60709 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
ACTBP60709 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
ACTBP60709 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTBP60709 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTBP60709 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTBP60709 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTBP60709 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTBP60709 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTBP60709 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTBP60709 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTBP60709 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTBP60709 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTBP60709 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTBP60709 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTBP60709 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTBP60709 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTBP60709 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTBP60709 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTBP60709 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTBP60709 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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ACTBP60709 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTBP60709 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTBP60709 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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ACTBP60709 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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ACTBP60709 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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ACTBP60709 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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ACTBP60709 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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ACTBP60709 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTBP60709 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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ACTBP60709 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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ACTBP60709 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTBP60709 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTBP60709 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTBP60709 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTBP60709 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTBP60709 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTBP60709 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTBP60709 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTBP60709 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTBP60709 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTBP60709 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTBP60709 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTBP60709 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTBP60709 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTBP60709 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTBP60709 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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