Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms