Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX5P50542 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX5P50542 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX5P50542 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX5P50542 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX5P50542 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX5P50542 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX5P50542 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX5P50542 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX5P50542 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX5P50542 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX5P50542 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX5P50542 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX5P50542 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX5P50542 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX5P50542 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX5P50542 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX5P50542 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX5P50542 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX5P50542 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX5P50542 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX5P50542 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX5P50542 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX5P50542 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX5P50542 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX5P50542 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX5P50542 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX5P50542 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX5P50542 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX5P50542 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX5P50542 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX5P50542 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX5P50542 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX5P50542 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX5P50542 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX5P50542 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX5P50542 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX5P50542 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX5P50542 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX5P50542 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX5P50542 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX5P50542 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX5P50542 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX5P50542 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX5P50542 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX5P50542 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX5P50542 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX5P50542 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX5P50542 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX5P50542 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX5P50542 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX5P50542 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX5P50542 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX5P50542 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX5P50542 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX5P50542 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX5P50542 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX5P50542 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX5P50542 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX5P50542 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms